Завершен
2020 / 2021

189 Моделирование популяций и изучение точности алгоритмов в популяционной геномике
Старт
14.09.2020
Паспорт проекта
Аннотация
Популяционная генетика - одна из наиболее активно развивающихся наук. В последние годы мы получили доступ к беспрецедентно большому количеству секвенированных последовательностей, представляющих разнообразные популяции, и покрывающих широкий спектр пространственных и временных точек. Анализ таких последователностей требует эффективных методов численной реализации моделей, а также понимания, как те или иные гипотезы или ошибки в параметрах могут влиять на гипотезы и оценки.
Отрасль
Информатика
Теги
Информатика
Цель
Реализация алгоритмов и моделей популяционной геномики, численная проверка теоретических результатов, а также численное исследование влияния различных популяционных параметров на генетическое разнообразие.
Ожидаемые результаты
- - Реализаяция симулятора генеалогий и их визуализация
- - Реализаяция модели MASCO, вычисление правдоподобия генеалогических деревьев
Форма и способы промежуточного контроля
Еженедельные личные встречи, отчёты, Slack, Trello.
Форма представления результатов
Презентация, глава для черновика статьи по результатам исследования, программный код на GitHub.
Ресурсное обеспечение
Суперкомпьютер НИУ ВШЭ, библиотека НИУ ВШЭ, ресурсы международной лаборатории статистической и вычислительной геномики.
Имеющийся задел
Заполнено автоматически
Заказчик
Организация / Заполнено автоматически