Завершен
2022 / 2023

1338 Применение скрытых марковских моделей в популяционной геномике
Старт
10.11.2022
Представление
01.02.2023
Постерная сессия
17.04.2023
Защита
05.06.2023
Паспорт проекта
Аннотация
Перемешивание популяций - один из основных процессов, создающих внутривидовое генетическое разнообразие. Научная проблема проекта состоит в математическом моделировании влияния процессов перемешивания в разных масштабах времени (например, древнее примешивание Неандертальцев к предкам современного человека или недавнее смешение европейцев, коренных американцев и африканцев в Мексике) на генетическое разнообразие, а также в разработке методов и анализе экспериментальных генетических данных для...
Отрасль
Информатика
Теги
Информатика
Цель
Реализовать метод определения древнего и недавнего примешивания в геномах современных популяций.
Ожидаемые результаты
- Реализация математической модели и метода определения древнего и недавнего примешивания в современных популяциях в виде программного кода на языке Python 3.
Форма и способы промежуточного контроля
Еженедельные личные встречи, отчёты, Slack.
Форма представления результатов
Научный отчёт, программный код на GitHub
Ресурсное обеспечение
Суперкомпьютер НИУ ВШЭ, библиотека НИУ ВШЭ, ресурсы международной лаборатории статистической и вычислительной геномики.
Имеющийся задел
Прототип HMM (программа на python 3)
Заказчик
НИУ ВШЭ / Международная лаборатория статистической и вычислительной геномики