Естественный отбор - это основной фактор эволюции. Результатом его действия на популяцию является увеличение числа тех особей, приспособленность которых к данным условиям обитания выше, чем у других. Одним из сценариев развития естественного отбора является адаптивная интрогрессия. Понимание её механизмов важно для предсказания времени смешения двух популяций, нахождения распределения длин участков генома, содержащих адаптационную аллель, обнаружения в геноме современного человека фрагментов...Подробнее

Разработка метода машинного обучения для изучения естественного отбора

Еженедельные личные встречи, отчёты, Slack, Trello.

Отчёт, несколько глав для черновика статьи по результатам исследования, программный код на GitHub.

Суперкомпьютер НИУ ВШЭ, библиотека НИУ ВШЭ, ресурсы международной лаборатории статистической и вычислительной геномики.

Разработан прототип метода для определения параметров адаптивной интрогрессии (сила естественного отбора, время периода нейтральности, доля примешивания, время примешивания и др.) при помощи глубокой нейронной сети-трансформера.