Завершен
2021 / 2022

255 Симулятор вирусных генеалогий
Старт
01.09.2021
Представление
11.11.2021
Постерная сессия
15.02.2022
Защита
18.04.2022
Паспорт проекта
Аннотация
**Аннотация 2021-2022**
Компьютерное моделирование играет ключевую роль при разработке новых методов анализа геномных данных, особенно для оценки корректности и точности работы методов. Симулятор вирусных генеалогий *VGsim*, разработанный сотрудниками международной лаборатории статистической и вычислительной геномики (в частности, в рамках этого проекта) на данный момент является самым эффективным решением для этих целей. На новом этапе проекта необходимо добавлять новый функционал, разработать...
Отрасль
Информатика
Теги
Информатика
Цель
Разработка симулятора вирусных генеалогий
Ожидаемые результаты
- * Новый пользовательский интерфейс и новые функции симулятора *VGsim*
- * Уточненная модель миграции
- * Tau-leaping алгоритм
Форма и способы промежуточного контроля
Еженедельные личные встречи, отчёты, Slack, Trello.
Форма представления результатов
Отчёт, препринт, программный код на GitHub.
Ресурсное обеспечение
Суперкомпьютер НИУ ВШЭ, библиотека НИУ ВШЭ, ресурсы международной лаборатории статистической и вычислительной геномики.
Имеющийся задел
Симулятор VGsim.
Программный код https://github.com/Genomics-HSE/VGsim
Препринт https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.04.21.21255891v3