Рабочий
2024 / 2025

2196 Информационно-поисковая система снимков электронного микроскопа для микробиологов
Старт
20.02.2025
Представление
14.04.2025 – 25.04.2025
Представление
06.06.2025 – 17.06.2025
Постерная сессия
05.11.2025 – 19.11.2025
Защита
26.01.2026 – 06.02.2026
Паспорт проекта
Аннотация
Это проект для сотрудников Лаборатории индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов НИЦ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи.
В лаборатории собрано большое количество (более 10000) снимков микроорганизмов, выполненных с помощью электронного микроскопа. Снимки каждого образца хранятся в отдельных каталогах файловой системы, а метаданные образцов записываются в бумажный журнал. При необходимости найти какой-либо снимок сотрудники ищут их вручную, просматривая журнал или снимки...
Отрасль
Информатика
Теги
Базы данных
ИПС
Цель
Снижение трудозатрат на поиск информации и повышение результативности поиска за счет систематизации данных о результатах микробиологических исследований, представленных в виде снимков электронного микроскопа, и создания информационно-поисковой системы с автоматической загрузкой данных.
Ожидаемые результаты
- Модуль обработки данных в виде Excel-файла, автоматически создающий на его основе БД с описанием всех образцов, снимков и их местоположений.
- Модуль обработки снимков, извлекающий из них текстовые метаданные, загружающий их в БД и сохраняющий метаданных в текстовых файлах в папке, относящей
- Интерфейс к БД
- Поисковая форма по всем метаданным
- Окно просмотра данных, включая просмотр снимков
- Функционал для добавления новых данных
- Верификация наличия внешних файлов
Форма и способы промежуточного контроля
Еженедельные онлайн-встречи, демонстрация работы компонент, заполнение карточек в трекере проекта, представление проекта, постерная сессия
Форма представления результатов
Демонстрация действующей системы; прием работы сотрудниками лаборатории индикации и ультраструктурного анализа микроорганизмов
Ресурсное обеспечение
Python, SQLite, свободно-распространяемая библиотека для распознавания текста на изображениях.
Имеющийся задел
Отсутствует
Заказчик
Организация / НИЦ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи