Логотип МИЭМ НИУ ВШЭ
Завершен
Логотип типа проекта Научно-исследовательская работа
Научно-исследовательская работа
2024 / 2025
Логотип проекта Моделирование популяций при помощи процесса вымирания-реколонизации

    2017 Моделирование популяций при помощи процесса вымирания-реколонизации

    Старт
    08.11.2024
    Представление
    27.01.2025 – 07.02.2025
    Постерная сессия
    14.04.2025 – 25.04.2025
    Защита
    13.05.2025 – 19.05.2025

    Паспорт проекта

    Аннотация

    В популяционных генетических исследованиях часто популяция моделируется как однородная или несколько однородных подпопуляций. Такое приближение хорошо подходит для описания географически изолированных популяций, когда можно однозначно классифицировать особей. Но в случае проживания популяций в одном географическом регионе, как например, в центральной полосе России, однозначно выделить отдельные популяции и отнести к ним особей затруднительно и даже некорректно. В рамках проекта будет изучена...

    Отрасль

    Информатика

    Теги

    Информатика

    Цель

    Исследовать свойства популяционной модели вымирания-реколонизации

    Ожидаемые результаты

    • ⁃ Реализован программный симулятор для модели вымирания-реколонизации в обратном времени.
      • ⁃ Обобщение понятия спектра частот аллелей для пространственной модели и изучение его свойств.
        • ⁃ Аналитическое и/или численное описание свойств модели таких как время жизни, гетерозиготность, вероятность фиксации аллеля.

          Форма и способы промежуточного контроля

          Личные встречи с руководителем, отчеты в Latex

          Форма представления результатов

          Отчет, программный код

          Ресурсное обеспечение

          Суперкомпьютер НИУ ВШЭ, ресурсы лаборатории

          Имеющийся задел

          - Реализован симулятор в прямом времени. - Получена аналитическая формула распределения времени жизни особей.

          Заказчик

          НИУ ВШЭ / Лаборатория статистической и вычислительной геномики