Завершен
2024 / 2025

2017 Моделирование популяций при помощи процесса вымирания-реколонизации
Старт
08.11.2024
Представление
27.01.2025 – 07.02.2025
Постерная сессия
14.04.2025 – 25.04.2025
Защита
13.05.2025 – 19.05.2025
Паспорт проекта
Аннотация
В популяционных генетических исследованиях часто популяция моделируется как однородная или несколько однородных подпопуляций. Такое приближение хорошо подходит для описания географически изолированных популяций, когда можно однозначно классифицировать особей. Но в случае проживания популяций в одном географическом регионе, как например, в центральной полосе России, однозначно выделить отдельные популяции и отнести к ним особей затруднительно и даже некорректно. В рамках проекта будет изучена...
Отрасль
Информатика
Теги
Информатика
Цель
Исследовать свойства популяционной модели вымирания-реколонизации
Ожидаемые результаты
- ⁃ Реализован программный симулятор для модели вымирания-реколонизации в обратном времени.
- ⁃ Обобщение понятия спектра частот аллелей для пространственной модели и изучение его свойств.
- ⁃ Аналитическое и/или численное описание свойств модели таких как время жизни, гетерозиготность, вероятность фиксации аллеля.
Форма и способы промежуточного контроля
Личные встречи с руководителем, отчеты в Latex
Форма представления результатов
Отчет, программный код
Ресурсное обеспечение
Суперкомпьютер НИУ ВШЭ, ресурсы лаборатории
Имеющийся задел
- Реализован симулятор в прямом времени.
- Получена аналитическая формула распределения времени жизни особей.
Заказчик
НИУ ВШЭ / Лаборатория статистической и вычислительной геномики