190 Оценка демографических параметров популяций с использованием нейронных сетей

Vladimir Shchur

руководитель проекта

Белов Александр Владимирович

руководитель направления

Старт

10.09.2020

Паспорт проекта

Аннотация

В рамках проекта будут изучены возможности применения рекуррентных и attention нейронных сетей для вычисления распределения времен коалесценции по вариативности генома в сценариях с одной однородной популяцией. В дальнейшем предполагается усложнение популяционных сценариев.

Отрасль

Информатика

Цель

Изучение возможности применения методов машинного и глубокого обучения к проблемам вычислительной геномике

Ожидаемые результаты

Программное обеспечение, генерирующее данные для обучения нейронных сетей при помощи компьютерного моделирования.
Разработано несколько разных структур для входных данных.
Конвейер для проведения численных и математических экспериментов с различными архитектурами нейронных сетей.
Несколько вычислительных моделей с использованием методов машинного и глубокого обучения для оценки популяционных сценариев для полногеномных последовательностей.

Форма и способы промежуточного контроля

Отчеты, личные встречи

Форма представления результатов

Отчет, черновик публикации

Ресурсное обеспечение

Вычислительный кластер НИУ ВШЭ, библиотека и электронные ресурсы НИУ ВШЭ

Имеющийся задел

Заполнено автоматически

Заказчик

Организация / Заполнено автоматически