1276 Поиск эпистатических взаимодействий в геноме Mycobacterium tuberculosis ассоциированных с лекарственной устойчивостью

Алексей Неверов

руководитель проекта

Vladimir Shchur

руководитель направления

Старт

11.10.2022

Представление

22.10.2022

Постерная сессия

23.01.2023

Защита

31.05.2023

Паспорт проекта

Аннотация

В последнее время предпринимаются попытки обнаружить новые гены и мутации, которые объясняют приобретение устойчивости возбудителя туберкулеза к противомикробным препаратам. Для того чтобы избежать быстрого приобретения устойчивости, туберкулез лечат коктейлями препаратов. Большое число секвенированных полногеномных генотипов с экспериментально измеренными фенотипами - восприимчивость/устойчивость к применяемым противомикробным препаратам позволяют проводить полногеномные ассоциативные...

Отрасль

Информатика

Цель

Найти пары мутаций в геноме M. tuberculosis, ассоциированные с приобретением устойчивости к лекарственным препаратам

Ожидаемые результаты

Построить DCA-модели белков M. tuberculosis и использовать их для оценки эффектов мутаций и их агрегации в сложные признаки
Построить модель связи генотип-фенотип, учитывающую пары агрегированных признаков
Найти одиночные и парные признаки, ассоциированные с приобретением лекарственной устойчивости