Закрыт
2024 / 2025

1263 Поиск сигнала изменения отбора в геноме вирусов гриппа А в период пандемии Covid-19
Старт
06.12.2024
Представление
27.01.2025 – 07.02.2025
Представление
14.04.2025 – 25.04.2025
Представление
06.06.2025 – 17.06.2025
Постерная сессия
05.11.2025 – 19.11.2025
Защита
26.01.2026 – 06.02.2026
Паспорт проекта
Аннотация
В период 2020 - 2021 в большинстве стран мира применялись жесткие меры социального разобщения с целью уменьшения числа контактов, что привело к резкому снижению заболеваемости гриппом и другими респираторными инфекциями. Однако, за этот период не произошло эллиминации вирусов гриппа. В международной базе данных GISAID за этот период доступно для анализа несколько тысяч изолятов вирусов гриппа А. Представляет интерес сравнить генетическую изменчивость вирусной популяции до и во время пандемии и...
Отрасль
Информатика
Теги
Информатика
Цель
Сравнить генетическую изменчивость вирусов гриппа А H3N2 и pdm09_H1N1 до пандемии Covid-19 и во время применения жестких мер социального разобщения 2020-2021 г.
Ожидаемые результаты
- черновик статьи
- Для трех подтипов вирусов гриппа A/H1N1, A/H3N2 и B/Victoria будут выделены локальные эпидемии в различных регионах Мира.
- Будет проведено сравнение динамики вирусных популяций локальных эпидемий до и во время карантина COVID-19 в разных регионах.
- Будут оценены интенсивности миграций вирусов гриппа между регионами до и во время карантина COVID-19.
Форма и способы промежуточного контроля
Еженедельные личные встречи, отчёты
Форма представления результатов
Отчёт, черновик текста статьи, программный код на GitHub
Ресурсное обеспечение
Суперкомпьютер НИУ ВШЭ, библиотека НИУ ВШЭ, ресурсы международной лаборатории статистической и вычислительной геномики
Имеющийся задел
https://doi.org/10.1073/pnas.1904246116
https://elifesciences.org/articles/82516
Заказчик
НИУ ВШЭ / Международная лаборатория статистической и вычислительной геномики