Логотип МИЭМ НИУ ВШЭ
Закрыт
Логотип типа проекта Научно-исследовательская работа
Научно-исследовательская работа
2024 / 2025
Логотип проекта Поиск сигнала изменения отбора в геноме вирусов гриппа А в период пандемии Covid-19

    1263 Поиск сигнала изменения отбора в геноме вирусов гриппа А в период пандемии Covid-19

    Старт
    06.12.2024
    Представление
    27.01.2025 – 07.02.2025
    Представление
    14.04.2025 – 25.04.2025
    Представление
    06.06.2025 – 17.06.2025
    Постерная сессия
    05.11.2025 – 19.11.2025
    Защита
    26.01.2026 – 06.02.2026

    Паспорт проекта

    Аннотация

    В период 2020 - 2021 в большинстве стран мира применялись жесткие меры социального разобщения с целью уменьшения числа контактов, что привело к резкому снижению заболеваемости гриппом и другими респираторными инфекциями. Однако, за этот период не произошло эллиминации вирусов гриппа. В международной базе данных GISAID за этот период доступно для анализа несколько тысяч изолятов вирусов гриппа А. Представляет интерес сравнить генетическую изменчивость вирусной популяции до и во время пандемии и...

    Отрасль

    Информатика

    Теги

    Информатика

    Цель

    Сравнить генетическую изменчивость вирусов гриппа А H3N2 и pdm09_H1N1 до пандемии Covid-19 и во время применения жестких мер социального разобщения 2020-2021 г.

    Ожидаемые результаты

    • черновик статьи
      • Для трех подтипов вирусов гриппа A/H1N1, A/H3N2 и B/Victoria будут выделены локальные эпидемии в различных регионах Мира.
        • Будет проведено сравнение динамики вирусных популяций локальных эпидемий до и во время карантина COVID-19 в разных регионах.
          • Будут оценены интенсивности миграций вирусов гриппа между регионами до и во время карантина COVID-19.

            Форма и способы промежуточного контроля

            Еженедельные личные встречи, отчёты

            Форма представления результатов

            Отчёт, черновик текста статьи, программный код на GitHub

            Ресурсное обеспечение

            Суперкомпьютер НИУ ВШЭ, библиотека НИУ ВШЭ, ресурсы международной лаборатории статистической и вычислительной геномики

            Имеющийся задел

            https://doi.org/10.1073/pnas.1904246116 https://elifesciences.org/articles/82516

            Заказчик

            НИУ ВШЭ / Международная лаборатория статистической и вычислительной геномики