Задача поиска ближайших соседей важна в молекулярном моделировании для оптимизации расчета сил и для расчета локальных параметров порядка. В литературе предложено несколько методов для решения этой задачи. В рамках проекта предлагается сравнить производительность нескольких подходов для типичных задач анализа молекулярно-динамических траекторий - расчет сил, расчет парных корреляционных функций, определение параметров порядка - и реализовать наиболее оптимальный подход для разрабатываемой в...Подробнее

Целью проекта является анализ производительности различных подходов к задаче поиска ближайших соседей внутри заданного радиуса (fixed-radius nearest neighbors, FRNN)

Обсуждение работы с руководителем проекта

Отчет, выступление на отчетной сессии МИЭМ, реализованный программный модуль

Доступ к вычислительному кластеру НИУ ВШЭ

Реализация списков ячеек в библиотеке MDProcessing.jl (https://gitlab.com/pisarevvv/mdprocessing.jl)